Prof. Erkan Kaptanoğlu, MD urodził się w Balikesir w Turcji w 1966 roku. Po ukończeniu szkoły podstawowej, średniej i średniej w Balikesir, ukończył studia na Wydziale Lekarskim Cerrahpasa na Uniwersytecie w Stambule w 1990 roku. Ukończył staż w Peterborough District Hospital i Lincoln County Hospital w Wielkiej Brytanii. Po roku obowiązkowej służby medycznej ukończył rezydenturę, którą rozpoczął w 1992 roku, w Ankara Numune Training and Research Hospital w 1997 roku i został specjalistą neurochirurgii. Po przydzieleniu do tego samego szpitala jako starszy rezydent w tym samym roku, studiował „uraz rdzenia kręgowego i regenerację rdzenia kręgowego” jako „pracownik naukowy” wraz z prof. Charlesem Tatorem, MD, na Wydziale Lekarskim Uniwersytetu w Toronto w latach 1998-1999. Po powrocie z Kanady w 1999 r. Ministerstwo Zdrowia zleciło mu utworzenie szpitala polowego i współpracę z Tureckim Czerwonym Półksiężycem w Hakkari, Şemdinli przez dwa miesiące. Po tym zadaniu zgłosił się na ochotnika do pracy przy akcji pomocy ofiarom trzęsienia ziemi w Marmarze w 1999 r.
W 2004 roku został profesorem nadzwyczajnym neurochirurgii. Uzyskał tytuł doktora nauk (Ph.D.) po ukończeniu programu doktoranckiego z zaawansowanej neurobiologii w latach 2000-2005 w Instytucie Nauk Medycznych Uniwersytetu Hacettepe. Dołączył do projektu autologicznej terapii komórkami macierzystymi w urazach rdzenia kręgowego u ludzi z Katedrami Neurochirurgii i Hematologii na Wydziale Lekarskim Uniwersytetu w Ankarze. W 2009 roku został mianowany zastępcą szefa 1. Kliniki Neurochirurgii w Szpitalu Numune w Ankarze, gdzie pracował.
W tym szpitalu, w którym pracował do 2010 r., nadzorował i uczestniczył w skomplikowanych operacjach neurochirurgii czaszkowej, pediatrycznej, kręgosłupa, urazowej i naczyniowej. Kontynuował badania naukowe na Uniwersytecie w Ankarze, w Katedrze Anatomii i laboratoriach badawczych Uniwersytetu w Ankarze i Uniwersytetu Hacettepe w celu opracowania strategii skomplikowanych operacji kręgosłupa.
Za swoje badania nad urazami rdzenia kręgowego i anatomią kręgosłupa zdobył wiele nagród, m.in.: Nagrodę Medyczną Szpitala Acibadem, I miejsce w 2000 r., Nagrodę Naukową im. Dr. Mahira Tevruza od Tureckiego Towarzystwa Neurochirurgicznego, Nagrodę Wheyt od Tübitaka i Towarzystwa Badań Mózgu w 2001 r., Nagrodę Naukową im. Hamita Ziya Gokalpa od Młodych Neurochirurgów od Tureckiego Towarzystwa Neurochirurgicznego, II miejsce w 2002 r., Nagrodę Naukową im. Yildiza Yalcinlara od Tureckiego Towarzystwa Neurochirurgicznego w 2004 r.
W 2010 roku udał się na Cypr, aby założyć Near East University Faculty of Medicine Hospital pod kierunkiem Hacettepe University i został mianowany profesorem zwyczajnym. W latach 2010-2015 pełnił funkcję założyciela i kierownika wydziału na Near East University oraz założyciela i zastępcy lekarza naczelnego w University Training and Research Hospital w TRNC.
W latach 2000-2001 był członkiem rady redakcyjnej czasopisma Türk Nöroşirurji Dergisi i Turkish Neurosurgery. W latach 2001-2006 był asystentem redaktora czasopism Türk Nöroşirurji Dergisi i Turkish Neurosurgery. W latach 2002-2003 był przewodniczącym Komitetu Młodych Neurochirurgów w ramach Turkish Neurosurgical Society. Został wybrany do zarządu grupy dyrektorów Turkish Neurosurgical Society Spinal and Peripheral Nerve Surgery Group, w latach 2003-2009. W 2013 roku został ponownie wybrany na członka zarządu grupy dyrektorów Turkish Neurosurgical Society Spinal and Peripheral Nerve Surgery Group. W 2015 roku został przewodniczącym zarządu grupy dyrektorów Turkish Neurosurgical Society Spinal and Peripheral Nerve Surgery Group. W 2018 roku został wybrany członkiem zarządu Tureckiej Akademii Neurochirurgii.
W 2015 roku został mianowany na stanowisko kierownika wydziału neurochirurgii na Wydziale Lekarskim Uniwersytetu Marmara. W tym samym okresie pełnił również funkcję dyrektora Instytutu Neurologii. W 2018 roku zakończył swoją kadencję jako kierownik wydziału. Pod koniec tej kadencji w 2019 roku przeszedł na emeryturę z obowiązków dyrektora Instytutu Neurologii i członka Wydziału Lekarskiego. Podczas swojej kadencji na Uniwersytecie Marmara nadzorował i towarzyszył operacjom chirurgicznym w skomplikowanych przypadkach od pacjentów czaszkowych po guzy mózgu (w szczególności glejaki, oponiaki i gruczolaki przysadki), krwotoki mózgowe, chorobę Parkinsona, urazy i neurochirurgię naczyniową. Wykonywał złożone operacje kręgosłupa, takie jak operacje deformacji kręgosłupa (np. skoliozy i kifozy), torakoskopowe operacje kręgosłupa i operacje guzów krzyżowych. Prowadził badania i eksperymenty nad terapią komórkami macierzystymi i regeneracją w urazach rdzenia kręgowego. W latach 2019-2020 obecnie kontynuuje praktykę kliniczną i operacje, a także lokalne i międzynarodowe studia akademickie, w swojej prywatnej klinice i Istanbul Brain and Spine Center.
Uczestniczył w licznych kursach i spotkaniach krajowych i międzynarodowych jako instruktor i mówca, był gościem na ponad 100 wydarzeniach i konferencjach. Opublikował 65 międzynarodowych, 35 krajowych artykułów naukowych, zredagował 7 książek, napisał 52 rozdziały książek. Pełnił funkcję w komitecie organizacyjnym 5 razy na spotkaniach międzynarodowych i 22 razy na spotkaniach krajowych.
Jest członkiem Tureckiego Stowarzyszenia Medycznego, Turecko-Cypryjskiego Stowarzyszenia Medycznego, Tureckiego Towarzystwa Neurochirurgicznego, Tureckiego Towarzystwa Kręgosłupa, EUROSPINE, AO Spine i Tureckiej Akademii Neurochirurgii.